در موقع فرمت کامل سکتورها یکبار نوشته و باز خوانی میشوند. اگر در ناحیه ای مشکلی باشد که برنامه نتواند آنرا بطور نرم افزاری حل کند (مشکل فیزیکی باشد)، آن ناحیه در FAT بعنوان بدسکتور منظور میشود و در موقع استفاده در آن ناحیه چیزی نوشته نمیشود. فقط یک مورد قابل توجه:
اکثرا بدسکتور فیزیکی در اثر برخورد head به صفحات دیسک (بخصوص در اثر ضربه در حال کارکردن هارد یعنی روشن بودن کامپیوتر) بوجود میاید. در اثر این برخورد ذرات بسیار ریزی از سطح دیسک جدا میشوند و در هارد بحرکت می افتند و با برخورد به نقاط سالم ویا در اثر گیر کردن بین هد و صفحه در نقاط سالم، باعث ایجاد بدسکتورهای جدید میشوند. بنابراین اگر در یک هارد بد سکتور فیزیکی ایجاد شد نباید اطلاعات خیلی مهم در آن قرار داد و باید بلافاصله از اطلاعات مهم آن بکآپ بگیرید.