گاهي اوقات ويروسها در واقع به فايلهاي سيستمي كه براي ويندوز مهم و حياتي هستند متصل ميشه و گاهي Delete كردن مستقيم آنها ممكنه به فايلهاي سيستمي و حياتي ويندوز آسيب برسونه و عملا در راه اندازي و كاركرد صحيح ويندوز اخلال ايجاد كنه.اين صحبت بدين معني نيست كه همه ويروسها را بايد قرنطينه كرد بلكه با قرنطينه كردن يك ويروس شما ميتوانيد به راحتي و بدون مشكلي به كار خود در ويندوز ادامه دهيد بدون اينكه نگران آسيب رساندن يا فعاليت ويروس مربوطه باشيد يعني ويروس در اين حالت هيچ كاري از پيش نخواهد برد بدون اينكه به فايلهاي سيستمي آسيبي وارد شود.